牡丹江市交通运输局是全市公路交通工作的主管部门，负责指导管理牡丹江市及所辖 6 个县（市）公路交通工作。现辖公路管理处、道路运输管理处、公路勘察设计院、公路工程质量监督造价站、交通职业中等专业学校和镜泊湖交通职工疗养院、航务管理处 7 个直属单位，共有职工 820 人。

（一）贯彻执行国家、省公路、水路行业发展战略、方针政策和法律法规；制定全市公路、水路行业方针、政策和规范性文件，并组织实施；参与拟定物流业发展规划和政策并监督实施；负责全市公路、水路行业中长期发展规划和年度计划，并组织实施；负责港口规划和岸线使用管理工作；负责全市公路交通综合统计和信息引导工作。

（二）承担涉及综合运输体系的规划协调工作，会同有关部门组织编制综合运输体系规划，负责交通运输枢纽规划和有关管理工作。

（三）承担道路、水路运输市场管理和监督职责。负责城乡客运及有关设施的规划和管理工作，负责指导城市公共汽车、出租汽车、汽车租赁、城市地铁、轨道交通等行业管理工作；指导全市道路运输、公路、水路交通行业体制改革工作；负责治理公路“三乱”工作。

（四）负责提出公路、水路固定资产投资规模和方向、国家和省财政性资金安排建议；提出规划内和年度计划规模内交通固定资产投资项目审查意见。

（五）承担公路、水路建设市场监管责任。承担公路、水路工程建设质量、造价、安全生产监督管理工作；指导农村公路建设和养护工作。

（六）组织实施公路、水路交通工程建设；负责公路、水路交通运输基础设施建设、管理和维护，承担有关交通重要设施的管理和维护；组织实施战备公路、水路建设、维护，承担国防动员有关工作。

（七）负责公路、水路行业安全生产和应急管理工作。依法组织或参与事故调查处理及水上救助打捞工作；按规定组织协调重点物资和紧急客货运输；负责市内高速公路及重点干线路网运行监测和协调工作。

（八）承担交通运输信息化建设，监测分析运行情况，开展相关统计工作，发布有关信息；负责公路、水路对外合作与外事工作。

（九）负责道路和水路运输行政管理、公路行政管理、航道行政管理、港口码头行政管理等工作。

（十）完成市委、市政府交办的其它工作任务。